2017年1月29日星期日

《How to be a modern scientist》读书笔记

论文撰写-交流的起点

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  • 合作者人数与版本控制
  • 先画图后写作
  • 语言简洁可能不利于发表,但有利于传播
  • 公开代码、数据、软件来提高研究的可重复性,被重复有利于提高学术影响力
  • 信任合作者
  • 马上动笔,拒绝完美
  • 博客文章、软件包在传播上与论文一样重要,甚至更重要
  • 论文由方法、数据、结果跟结论组成,先完成前三个
  • 阴性结果也是结果,对其他科研人员也有参考价值,也要考虑发表,哪怕是博客发表

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  • 所见即所得
    • 在线协作:google docs/石墨 
    • 离线协作:word
  • 排版软件
    • Overleaf
    • sharelatex
    • rstudio

学术出版-交流的渠道

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  • 预先发表
  • 投稿到你设想中读者会读到的地方
  • 通过社交网络传播你的发现
  • 开放获取???基金与影响力传播
  • 延长论文的半衰期

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审稿-匿名交流的权限

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  • 尽快,否则不做
  • 可以进行发表后审稿或公开评论
  • 流程是主编确认投稿是否合乎范围,分配给专业副主编,副主编寻找审稿人
  • 如果对方改了也不能达到你认为的标准,拒绝而不是大修或小修

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数据分享

  • figshare
  • Open Science Framework
  • Dataverse
  • 包含原始数据,处理后数据,数据收集的信息与处理代码
  • 随论文一同公布
  • 尊重数据生产者

博客/个人网站/公众号

  • 记录学科内的重要进展
  • 如果个人忙不过来,可以考虑多人合作编辑或找到组织成为作者
  • 跟业界联系的渠道
  • 提高自己交流与可视化的能力
  • 每个人每天都会在互联网上花费时间,博客是有机融合
  • 互联网只关注异常、争论与胜负而不是共识,共识可以交给科普
  • 质疑要比实际操作轻松
  • 对自己文章要按互联网信息传播速度回复或形成论文发表来回应
  • 不回复质疑会影响学术声誉
  • 博客行文会影响别人对你的看法

代码

  • 公开代码并记录版本 githubbitbucket
  • 链接到对应的论文上
  • 代码最好经过审查 cran bioconductor ropenscience pypi
  • rmarkdown jupyter 文学化编程
  • 给未来的自己做注释
  • 记录运行环境保证重复性
  • Good writers borrow from other authors, great authors steal outright 

社交媒体

  • 构建/加入在线学术社团
  • 放大影响力
  • 构建趋势感
  • 线上线下互联
  • 多使用图片
  • 谨慎介入糊涂账话题

教学

  • 教案与视频在线化
  • 在问答社区贡献答案 quora stackoverflow reddit 知乎 果壳
  • slideshare speakerdeck figshare
  • mooc 课程尽量短(少于10分钟) 脸皮要厚 注意产权

书籍出版

  • 在线出版
  • 允许反馈
  • leanpubgitbookamazon kindle direct publishingbookdown
  • 按需求出版纸质版 lulu.com

内部学术交流

  • slackhipchat
  • 按项目交流
  • 定期交流
  • 人员管理要及时
  • 分享文献
  • 分享实验室内部规定

演讲

  • 娱乐而不是教诲
  • 写给观众而不是自己
  • 用所见即所得方式
  • 首页有联系方式
  • 大字体
  • 有链接
  • 对比色
  • 图片文字比1000:1
  • 解释图片时先说干什么用的,然后解释坐标,然后解释关键现象
  • 解释公式时用文字不要用单一符号,脚标不要太多
  • 注意时间

文献研读

  • 科技类 naturepnasscience
  • 健康类 NEJMJAMA
  • 综合期刊 plos one/peerj
  • 专业顶级期刊
  • 会议论文
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学术声誉

  • 论文第一
  • 定量化
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  • cv优化
  • 跟老司机交流
  • 职业规划
  • 常任轨研究教授/常任轨文理学院教授/研究性教职/业界

在线身份

  • 常用ID 简短难重复
  • 商用email
  • 线上线下一致